Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Rnf144aQ925F3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Rnf144aQ925F3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Rnf144aQ925F3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Rnf144aQ925F3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Rnf144aQ925F3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rnf144aQ925F3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf144aQ925F3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Rnf144aQ925F3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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