Protein–RNA interactions for Protein: Q924D0

Rtn4ip1, Reticulon-4-interacting protein 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4ip1Q924D0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtn4ip1Q924D0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtn4ip1Q924D0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms