Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med28Q920D3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms