Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trpm2Q91YD4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trpm2Q91YD4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trpm2Q91YD4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trpm2Q91YD4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Trpm2Q91YD4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Trpm2Q91YD4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trpm2Q91YD4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trpm2Q91YD4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trpm2Q91YD4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trpm2Q91YD4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpm2Q91YD4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpm2Q91YD4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpm2Q91YD4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpm2Q91YD4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpm2Q91YD4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpm2Q91YD4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpm2Q91YD4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpm2Q91YD4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpm2Q91YD4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpm2Q91YD4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpm2Q91YD4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpm2Q91YD4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trpm2Q91YD4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trpm2Q91YD4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trpm2Q91YD4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trpm2Q91YD4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trpm2Q91YD4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trpm2Q91YD4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trpm2Q91YD4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trpm2Q91YD4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trpm2Q91YD4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trpm2Q91YD4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Trpm2Q91YD4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trpm2Q91YD4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpm2Q91YD4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms