Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Basp1Q91XV3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Basp1Q91XV3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Basp1Q91XV3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Basp1Q91XV3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Basp1Q91XV3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Basp1Q91XV3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Basp1Q91XV3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Basp1Q91XV3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Basp1Q91XV3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms