Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SelenomQ8VHC3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SelenomQ8VHC3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms