Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt25Q8VCW2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt25Q8VCW2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms