Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RfxapQ8VCG9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RfxapQ8VCG9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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