Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc9Q8VC31 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc9Q8VC31 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms