Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms