Protein–RNA interactions for Protein: Q8R395

Commd5, COMM domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd5Q8R395 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Commd5Q8R395 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Commd5Q8R395 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Commd5Q8R395 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Commd5Q8R395 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Commd5Q8R395 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Commd5Q8R395 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd5Q8R395 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Commd5Q8R395 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd5Q8R395 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd5Q8R395 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Commd5Q8R395 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Commd5Q8R395 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
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Commd5Q8R395 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Commd5Q8R395 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Commd5Q8R395 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Commd5Q8R395 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Commd5Q8R395 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Commd5Q8R395 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Commd5Q8R395 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Commd5Q8R395 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Commd5Q8R395 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Commd5Q8R395 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Commd5Q8R395 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Commd5Q8R395 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Commd5Q8R395 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Commd5Q8R395 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Commd5Q8R395 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Commd5Q8R395 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Commd5Q8R395 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Commd5Q8R395 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Commd5Q8R395 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Commd5Q8R395 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Commd5Q8R395 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
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