Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3A2

Trpt1, tRNA 2'-phosphotransferase 1, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpt1Q8K3A2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Trpt1Q8K3A2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpt1Q8K3A2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpt1Q8K3A2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpt1Q8K3A2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpt1Q8K3A2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Trpt1Q8K3A2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpt1Q8K3A2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpt1Q8K3A2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpt1Q8K3A2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpt1Q8K3A2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpt1Q8K3A2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpt1Q8K3A2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Trpt1Q8K3A2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trpt1Q8K3A2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpt1Q8K3A2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpt1Q8K3A2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpt1Q8K3A2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpt1Q8K3A2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trpt1Q8K3A2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trpt1Q8K3A2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trpt1Q8K3A2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trpt1Q8K3A2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpt1Q8K3A2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpt1Q8K3A2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpt1Q8K3A2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trpt1Q8K3A2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trpt1Q8K3A2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Trpt1Q8K3A2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trpt1Q8K3A2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Trpt1Q8K3A2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Trpt1Q8K3A2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Trpt1Q8K3A2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Trpt1Q8K3A2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Trpt1Q8K3A2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpt1Q8K3A2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpt1Q8K3A2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpt1Q8K3A2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpt1Q8K3A2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpt1Q8K3A2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpt1Q8K3A2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpt1Q8K3A2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpt1Q8K3A2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpt1Q8K3A2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpt1Q8K3A2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpt1Q8K3A2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpt1Q8K3A2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpt1Q8K3A2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpt1Q8K3A2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trpt1Q8K3A2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trpt1Q8K3A2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trpt1Q8K3A2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trpt1Q8K3A2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Trpt1Q8K3A2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Trpt1Q8K3A2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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