Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccm2Q8K2Y9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccm2Q8K2Y9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms