Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Paf1Q8K2T8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Paf1Q8K2T8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms