Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Prkd3Q8K1Y2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prkd3Q8K1Y2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms