Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nek9Q8K1R7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek9Q8K1R7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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