Protein–RNA interactions for Protein: Q8K119

Pms1, PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms1Q8K119 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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Pms1Q8K119 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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Pms1Q8K119 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Pms1Q8K119 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Pms1Q8K119 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Pms1Q8K119 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Pms1Q8K119 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Pms1Q8K119 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Pms1Q8K119 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Pms1Q8K119 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pms1Q8K119 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Pms1Q8K119 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pms1Q8K119 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pms1Q8K119 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pms1Q8K119 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pms1Q8K119 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pms1Q8K119 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pms1Q8K119 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pms1Q8K119 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pms1Q8K119 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pms1Q8K119 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pms1Q8K119 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pms1Q8K119 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pms1Q8K119 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Pms1Q8K119 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pms1Q8K119 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pms1Q8K119 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pms1Q8K119 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pms1Q8K119 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms