Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RybpQ8CCI5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RybpQ8CCI5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms