Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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Lrrn3Q8CBC6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrn3Q8CBC6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms