Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Triml1Q8BVP1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms