Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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Vipas39Q8BGQ1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
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Vipas39Q8BGQ1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Vipas39Q8BGQ1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Vipas39Q8BGQ1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vipas39Q8BGQ1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
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Vipas39Q8BGQ1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
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Vipas39Q8BGQ1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Vipas39Q8BGQ1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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Vipas39Q8BGQ1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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Vipas39Q8BGQ1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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Vipas39Q8BGQ1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vipas39Q8BGQ1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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