Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
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Atg4cQ811C2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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Atg4cQ811C2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg4cQ811C2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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Atg4cQ811C2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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