Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcdh8Q7TSK3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms