Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

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Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Dsg1bQ7TSF1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Dsg1bQ7TSF1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Dsg1bQ7TSF1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dsg1bQ7TSF1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg1bQ7TSF1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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