Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dsg1cQ7TSF0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dsg1cQ7TSF0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms