Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc93Q7TQK5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms