Protein–RNA interactions for Protein: Q7M764

Usp17le, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein E, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17leQ7M764 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp17leQ7M764 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp17leQ7M764 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp17leQ7M764 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp17leQ7M764 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp17leQ7M764 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp17leQ7M764 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp17leQ7M764 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp17leQ7M764 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp17leQ7M764 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp17leQ7M764 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp17leQ7M764 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp17leQ7M764 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp17leQ7M764 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp17leQ7M764 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp17leQ7M764 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp17leQ7M764 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp17leQ7M764 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp17leQ7M764 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp17leQ7M764 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp17leQ7M764 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp17leQ7M764 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp17leQ7M764 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp17leQ7M764 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp17leQ7M764 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp17leQ7M764 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp17leQ7M764 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp17leQ7M764 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp17leQ7M764 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp17leQ7M764 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp17leQ7M764 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp17leQ7M764 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp17leQ7M764 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp17leQ7M764 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp17leQ7M764 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp17leQ7M764 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp17leQ7M764 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp17leQ7M764 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms