Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms