Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY09

CEACAM20, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM20Q6UY09 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CEACAM20Q6UY09 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CEACAM20Q6UY09 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CEACAM20Q6UY09 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CEACAM20Q6UY09 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CEACAM20Q6UY09 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEACAM20Q6UY09 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CEACAM20Q6UY09 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEACAM20Q6UY09 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEACAM20Q6UY09 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEACAM20Q6UY09 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms