Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vstm2lQ6PDS0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms