Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B2

Ubald1, UBA-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubald1Q6P3B2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubald1Q6P3B2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubald1Q6P3B2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubald1Q6P3B2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubald1Q6P3B2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubald1Q6P3B2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubald1Q6P3B2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubald1Q6P3B2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubald1Q6P3B2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubald1Q6P3B2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubald1Q6P3B2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubald1Q6P3B2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubald1Q6P3B2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubald1Q6P3B2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubald1Q6P3B2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubald1Q6P3B2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubald1Q6P3B2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubald1Q6P3B2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubald1Q6P3B2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubald1Q6P3B2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubald1Q6P3B2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubald1Q6P3B2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubald1Q6P3B2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105 ms