Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
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Krt77Q6IFZ6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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Krt77Q6IFZ6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt77Q6IFZ6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Krt77Q6IFZ6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Krt77Q6IFZ6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Krt77Q6IFZ6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
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Krt77Q6IFZ6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt77Q6IFZ6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt77Q6IFZ6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt77Q6IFZ6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt77Q6IFZ6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt77Q6IFZ6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt77Q6IFZ6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt77Q6IFZ6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt77Q6IFZ6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt77Q6IFZ6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt77Q6IFZ6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt77Q6IFZ6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt77Q6IFZ6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt77Q6IFZ6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt77Q6IFZ6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt77Q6IFZ6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt77Q6IFZ6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt77Q6IFZ6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt77Q6IFZ6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt77Q6IFZ6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt77Q6IFZ6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt77Q6IFZ6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt77Q6IFZ6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt77Q6IFZ6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt77Q6IFZ6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt77Q6IFZ6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt77Q6IFZ6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt77Q6IFZ6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt77Q6IFZ6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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