Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdzrn3Q69ZS0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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