Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp1Q62442 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp1Q62442 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms