Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema3bQ62177 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema3bQ62177 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms