Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SspnQ62147 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SspnQ62147 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SspnQ62147 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SspnQ62147 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SspnQ62147 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SspnQ62147 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SspnQ62147 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SspnQ62147 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SspnQ62147 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SspnQ62147 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SspnQ62147 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms