Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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PcolceQ61398 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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PcolceQ61398 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcolceQ61398 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
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PcolceQ61398 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcolceQ61398 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcolceQ61398 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcolceQ61398 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcolceQ61398 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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PcolceQ61398 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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PcolceQ61398 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcolceQ61398 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PcolceQ61398 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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PcolceQ61398 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcolceQ61398 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcolceQ61398 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcolceQ61398 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcolceQ61398 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcolceQ61398 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PcolceQ61398 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcolceQ61398 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcolceQ61398 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcolceQ61398 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcolceQ61398 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcolceQ61398 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcolceQ61398 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcolceQ61398 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PcolceQ61398 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcolceQ61398 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcolceQ61398 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcolceQ61398 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcolceQ61398 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PcolceQ61398 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PcolceQ61398 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcolceQ61398 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcolceQ61398 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcolceQ61398 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PcolceQ61398 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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