Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klf3Q60980 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf3Q60980 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms