Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Epha1Q60750 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epha1Q60750 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms