Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Foxd4Q60688 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd4Q60688 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms