Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ItgaeQ60677 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ItgaeQ60677 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms