Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprnQ60673 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprnQ60673 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms