Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms