Protein–RNA interactions for Protein: Q5M956

Kctd1, BTB/POZ domain-containing protein KCTD1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd1Q5M956 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Kctd1Q5M956 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kctd1Q5M956 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms