Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfmbt2Q5DTW2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt2Q5DTW2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms