Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGO2Q562F6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms