Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnga4Q3UW12 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.1 ms