Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtl4Q3URY0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms