Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdkl4Q3TZA2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkl4Q3TZA2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkl4Q3TZA2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkl4Q3TZA2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkl4Q3TZA2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkl4Q3TZA2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkl4Q3TZA2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkl4Q3TZA2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkl4Q3TZA2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkl4Q3TZA2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkl4Q3TZA2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms