Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VrtnQ3SYK4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms